Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF2Q96GP6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF2Q96GP6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF2Q96GP6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms