Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATG4CQ96DT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG4CQ96DT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms