Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC11Q96DB2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC11Q96DB2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC11Q96DB2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms