Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKBQ93100 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PHKBQ93100 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKBQ93100 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms