Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD2Q92925 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCD2Q92925 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCD2Q92925 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCD2Q92925 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCD2Q92925 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCD2Q92925 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCD2Q92925 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCD2Q92925 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms