Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATOH1Q92858 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATOH1Q92858 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATOH1Q92858 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATOH1Q92858 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATOH1Q92858 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATOH1Q92858 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATOH1Q92858 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms