Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC9Q92623 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC9Q92623 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC9Q92623 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms