Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK1Q8TDC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRSK1Q8TDC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms