Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APPL2Q8NEU8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
APPL2Q8NEU8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APPL2Q8NEU8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APPL2Q8NEU8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APPL2Q8NEU8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms