Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC150Q8NCX0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC150Q8NCX0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC150Q8NCX0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms