Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA5B2Q8N398 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms