Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPC2Q8N158 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPC2Q8N158 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC2Q8N158 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC2Q8N158 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms