Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHACTR4Q8IZ21 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR4Q8IZ21 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR4Q8IZ21 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms