Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NELFCDQ8IXH7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELFCDQ8IXH7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms