Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD3Q7L5L3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD3Q7L5L3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms