Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2R2Q712K3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2R2Q712K3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2R2Q712K3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2R2Q712K3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2R2Q712K3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms