Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY4Q6ZNE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY4Q6ZNE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY4Q6ZNE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms