Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK4Q6UW60 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK4Q6UW60 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms