Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L2Q6R6M4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L2Q6R6M4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L2Q6R6M4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms