Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A1Q6PCB7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A1Q6PCB7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms