Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRNP1Q6NT89 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRNP1Q6NT89 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms