Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WSCD1Q658N2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WSCD1Q658N2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms