Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYDE2Q5VT97 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYDE2Q5VT97 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYDE2Q5VT97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms