Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM164Q5U3C3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM164Q5U3C3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms