Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDLRAD1Q5T700 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LDLRAD1Q5T700 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LDLRAD1Q5T700 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms