Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TREML2Q5T2D2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TREML2Q5T2D2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms