Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHYHD1Q5SRE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms