Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP47Q5SQN1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP47Q5SQN1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP47Q5SQN1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms