Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHC1Q5JVL4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFHC1Q5JVL4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms