Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB41Q5JT25 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB41Q5JT25 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB41Q5JT25 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms