Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFHC2Q5JST6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC2Q5JST6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC2Q5JST6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC2Q5JST6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC2Q5JST6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC2Q5JST6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC2Q5JST6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms