Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FAM47AQ5JRC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM47AQ5JRC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms