Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC01620Q4KN68 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01620Q4KN68 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms