Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL9Q3SXZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms