Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP20-2Q3LI61 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP20-2Q3LI61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms