Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFAF6Q330K2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF6Q330K2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms