Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPP1Q16831 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP1Q16831 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP1Q16831 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms