Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCSK7Q16549 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK7Q16549 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK7Q16549 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCSK7Q16549 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK7Q16549 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK7Q16549 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK7Q16549 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK7Q16549 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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