Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIP11Q15643 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIP11Q15643 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms