Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PUM3Q15397 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PUM3Q15397 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PUM3Q15397 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PUM3Q15397 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
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