Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms