Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCAPQ14761 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCAPQ14761 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAPQ14761 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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