Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CNGB1Q14028 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGB1Q14028 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CNGB1Q14028 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
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