Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRSQ13332 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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PTPRSQ13332 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRSQ13332 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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PTPRSQ13332 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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PTPRSQ13332 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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PTPRSQ13332 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
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