Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFSWAPQ12872 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFSWAPQ12872 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFSWAPQ12872 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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