Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWF1Q12792 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TWF1Q12792 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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