Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDR1Q08345 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDR1Q08345 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms