Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLTCQ00610 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLTCQ00610 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLTCQ00610 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms