Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP1P56715 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP1P56715 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP1P56715 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RP1P56715 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP1P56715 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP1P56715 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP1P56715 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP1P56715 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP1P56715 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP1P56715 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP1P56715 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP1P56715 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP1P56715 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP1P56715 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RP1P56715 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP1P56715 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP1P56715 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RP1P56715 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RP1P56715 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RP1P56715 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1P56715 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1P56715 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1P56715 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1P56715 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1P56715 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1P56715 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RP1P56715 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1P56715 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1P56715 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1P56715 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1P56715 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1P56715 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1P56715 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1P56715 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1P56715 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1P56715 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1P56715 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1P56715 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1P56715 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1P56715 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1P56715 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1P56715 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1P56715 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1P56715 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1P56715 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1P56715 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1P56715 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1P56715 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1P56715 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1P56715 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1P56715 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1P56715 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1P56715 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1P56715 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1P56715 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1P56715 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1P56715 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RP1P56715 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP1P56715 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP1P56715 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RP1P56715 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RP1P56715 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RP1P56715 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RP1P56715 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RP1P56715 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RP1P56715 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1P56715 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1P56715 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1P56715 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1P56715 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1P56715 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1P56715 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1P56715 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1P56715 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1P56715 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1P56715 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1P56715 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1P56715 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP1P56715 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP1P56715 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP1P56715 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1P56715 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1P56715 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1P56715 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1P56715 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1P56715 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1P56715 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1P56715 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1P56715 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1P56715 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms