Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP5P51878 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP5P51878 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP5P51878 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP5P51878 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP5P51878 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP5P51878 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP5P51878 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP5P51878 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP5P51878 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP5P51878 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP5P51878 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP5P51878 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP5P51878 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP5P51878 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP5P51878 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP5P51878 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP5P51878 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP5P51878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP5P51878 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP5P51878 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP5P51878 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP5P51878 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP5P51878 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP5P51878 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP5P51878 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP5P51878 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP5P51878 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP5P51878 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP5P51878 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP5P51878 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP5P51878 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP5P51878 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP5P51878 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP5P51878 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP5P51878 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP5P51878 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP5P51878 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP5P51878 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP5P51878 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP5P51878 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP5P51878 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP5P51878 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP5P51878 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP5P51878 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP5P51878 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP5P51878 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASP5P51878 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASP5P51878 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASP5P51878 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP5P51878 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP5P51878 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP5P51878 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP5P51878 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP5P51878 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP5P51878 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP5P51878 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP5P51878 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP5P51878 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP5P51878 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP5P51878 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP5P51878 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP5P51878 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP5P51878 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP5P51878 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP5P51878 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP5P51878 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP5P51878 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
CASP5P51878 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP5P51878 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP5P51878 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP5P51878 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms